Намерих отговора тук Създаване на база данни при стартиране на docker-compose
Базата данни вероятно вече е инициализирана. Изображението на MySQL не преконфигурира базата данни отново и отново, то прави това само веднъж. За да нулирате базата данни, изпълнете docker-compose down -v
където -v
премахва обемите, дефинирани в раздела за обем.