Например отворете файл с помощта на fopen() , прочетете съдържанието му с помощта на fread() и след това запазете това съдържание на, напр. BLOB поле в базата данни.
Винаги е по-добро решение да съхранявате файл(ове) във файлова система, както Dagon предложи в коментар.
