Намерих решението.
С UPDATE заявка можем да извлечем оригиналната стойност от базата данни, да я преобразуваме отново в int, шестнадесетичен и дехекс (може ли това да бъде допълнително съкратено?) и получаваме правилната двоична стойност в базата данни.
UPDATE table SET ip = UNHEX(HEX(CAST(ip AS UNSIGNED)))
