В моя случай открих, че първопричината е MySQL-Python драйвер за база данни и поправката е да се използват други MySQL драйвери за Python (напр. mysqlclient ).
$ pip uninstall MySQL-Python
$ pip install mysqlclient
MySQL-python се оказа много стар (последният комит беше преди 7 години). mysqlclient е съвременната му версия с много подобрения и корекции на грешки.
Повече подробности за моята корекция и открития тук .