Благодарение на коментара на @marcus-adams разбрах. Трябва да използвате '/qn', '/x' и '{installer:mysqlUninstallKey}' като отделни аргументи в действието 'Изпълни изпълним файл или пакетен файл' на install4j. Ако използвате 1 аргумент с интервали, той не работи. С това работи на 32-битови и 64-битови.
