Не можете, стига чрез join имаш предвид използването на SQL JOINS . Това е така, защото SQL заявката винаги се изпраща към конкретна база данни или сървър.
Трябва да изпратите две независими заявки, по една за всяка база данни и след това да предоставите някаква логика в PHP, за да ги присъедините или чрез array_merge (пълно присъединяване) или някои по-разширени скриптове.
Не мога да помогна повече, без да видите някакъв собствен код.