Можете да използвате SQL Server Compact, който може да се инсталира отделно или да се внедри като част от вашето приложение.
Вижте тук:Как да разположите SQL Server Compact Edition 4.0?
И тук:https://msdn.microsoft .com/en-gb/library/aa983326(v=vs.110).aspx
Вашият DB код в приложението ви – освен низа ви за връзка – не трябва да се променя, тъй като вече използвате някаква версия на SQL Server.
Има и SQLite, който доколкото знам е добре оценен, но знам много малко за него. http://www.sqlite.org/
Надявам се това да помогне!