Множество възможности за LINES TERMINATED BY и FELDS TERMINATED BY - MySQL

Опитайте LINES TERMINATED BY '\r\n'

Това ще работи за файлове, завършващи на редове с '\r\n', но също и с '\r' и '\n'. От MySQL документите:

[РЕДАКТИРАНО]

Трябва също да добавите \r\n към клаузата FIELDS TERMINATED BY за да каже на анализатора да не включва символите за край на редовете в последното поле на първия ред. Така че

FIELDS TERMINATED BY ';, \t\r\n'

ще работи в повечето случаи.