Използвайте следното, за да деактивирате ограниченията:
-- disable UNIQ, PK, ...
ALTER TABLE <tablename> DISABLE KEYS;
-- diable FK
SET FOREIGN_KEY_CHECKS=0;
Проверете например този сайт за повече примери. Възстановяване с:
SET FOREIGN_KEY_CHECKS=1;
ALTER TABLE <tablename> ENABLE KEYS;
От препратката:
- foreign_key_checks
- DКЛЮЧОВЕ, КАЧИ СЕ ИЗВЪРЗВАТ :"Използвайте ALTER TABLE ... ИЗКЛЮЧЕТЕ КЛЮЧОВЕ, за да кажете на MySQL да спре да актуализира неуникални индекси. ..."
p.s. :от съвети за настройка на производителността на InnoDB
SET autocommit=0;
SET unique_checks=0;
SET foreign_key_checks=0;