MySql Вмъкнете, ако не съществуват две двойки колони, в противен случай актуализирайте

за да работи ON DUPLICATE KEY UPDATE израз, трябва да дефинирате unique клавиша върху двете колони,

CREATE  TABLE IF NOT EXISTS tbl_member_doc_read 
(
`read_id` INTEGER(10) UNSIGNED NOT NULL PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT ,
`member_id` INTEGER(10) UNSIGNED NOT NULL ,
`doc_id` INTEGER(10) UNSIGNED NOT NULL ,
`status` INTEGER(1) DEFAULT '0',
FOREIGN KEY (`member_id`) REFERENCES tbl_member(`member_id`),
FOREIGN KEY (`doc_id`) REFERENCES tbl_doc(`doc_id`),
CONSTRAINT tb_uq UNIQUE (member_id, doc_id)
) ENGINE=InnoDB CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci;

след това премахнете WHERE клауза

INSERT INTO tbl_member_doc_read (member_id, doc_id, status) 
VALUES(1,2,1) 
ON DUPLICATE KEY UPDATE 
status = VALUES(status)

• SQLPiddle Демо