Библиотеката R mysql зависи от libmysqlclient/libmariadbclient. Липсващата caching_sha2_password изглежда е индикатор, че стара версия на mysqlclient или libmariadbclient не е инсталирана. Едва наскоро caching_sha2_password беше добавен към mariadb (3.0.8)