Съгласно документите за Flask-SQLAlchemy
наследяване от db.Model
автоматично ще настрои името на таблицата вместо вас.
Виждате това съобщение, защото нямате дефиниран първичен ключ за тази таблица. Съобщението за грешка не е полезно, но добавянето на първичен ключ ще реши този проблем.