nuke_users модул експортира функция, която при извикване връща Model . Тъй като не извиквате тази функция, тя не връща Model , и следователно функцията, която търсите, не съществува.
За да извикате тази експортирана функция, ще трябва да подадете sequelize екземпляр и DataTypes , както е така:
var User = require('../models/nuke_users')(sequelize, DataTypes);
Във вашия случай използвате зареждане в index.js файл и експортира db обект, който съдържа моделите, обозначени с тяхното име.
var models = require('../models'); // loads index.js
var User = models.nuke_user; // the model keyed by its name
User.findOne(...); // search the model