„MySQL сървърът е изчезнал“ е симптом на грешка при максимален пакет.http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/gone-away.html
Променете вашата команда, за да посочите по-голяма стойност за max_allowed_packet.
mysqldump --opt db1 | mysql --max_allowed_packet=32M db2
По подразбиране е 1M. Може да са необходими опити и грешки, за да се получи правилната стойност.http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/server-system-variables.html#sysvar_max_allowed_packet