Изглежда, че използвате InnoDB таблици, така че трябва също да копирате ib* файлове в папката с данни (но това ще презапише всяка таблица на InnoDB, създадена при нова инсталация.)
Като алтернатива (още по-добре) можете да зададете параметър 'datadir' в конфигурационния файл и да посочите пътя до папката с данни в старата инсталация.
