Има има начин, но на етапа рамката е точно сега това е неасфалтиран път. По принцип ще трябва да напишете обвивка, която да превежда от SQL в Minimongo на Meteor и обратно. Това не е изпълнима задача, ако вече не сте майстор на Метеори и Монго.
Имаше опити да се напише такъв адаптер. Най-напредналият, който знам е това:https://github.com/drorm/meteor-sql . Възможно е да се използва за игра, но не мисля, че е готов за производство. Освен това в момента няма не начин да използвате системата за акаунти на Meteor с нещо различно от Mongo. Или трябва да го използвате така или иначе за потребителски акаунти, или да се откажете от голямото удобство, което предоставят.
Бих те посъветвал да пробваш Meteor такъв, какъвто е в момента, заедно с Mongo - по-лесно е, отколкото си мислиш. Не добавя твърде много крива на обучение и освен операторите за филтриране и актуализиране, няма да забележите, че изобщо използвате някакъв странен db - това е точно като работа с естествени Javascript обекти. Няма нужда от схема, миграции, картографиране на обекти. Просто взимате данни, поставяте ги в колекция и забравяте всичко останало, за което SQL ви кара да мислите.