Може да се наложи да инсталирате заглавките и библиотеките за разработка на Python 3 и MySQL по следния начин:За UBUNTU или Debian
sudo apt-get install python3-dev default-libmysqlclient-dev build-essential
Red Hat / CentOS
sudo yum install python3-devel mysql-devel
След това опитайте
pip install mysqlclient