Мисля, че вече изпълнявате миграция с име version_1.0001_initial преди да преименувате приложението на бета . Всичко, от което се нуждаете, е да актуализирате записите в базата данни в таблицата django_migrations и преименувайте старите миграции на приложения към новото име, като използвате този SQL израз:
UPDATE django_migrations SET app = 'beta' WHERE app = 'version_1';