(setq sql-mysql-program "/path/to/your/mysql")
(setq sql-user "mysql user")
(setq sql-password "password")
(setq sql-server "mysql-server")
(setq sql-mysql-options "optional command line options")
предоставяне на някои стойности на тези променливи чрез вашия .emacs
би трябвало да помогне на вашата ситуация.