Как мога да кача отделни CSV редове в различни таблици в PHP?

Във вашия случай най-доброто решение е най-простото, така че просто създавайки пет заявки, можете дори да го направите в цикъла:

$pdo = new PDO("mysql:host=127.0.0.1;dbname=yourdbname;charset=utf8", "username", "password");

if (($handle = fopen("test.csv", "r")) !== FALSE) {
    $row = 1;
    while (($data = fgetcsv($handle, 1000, ",")) !== FALSE) {
        if ($row == 1) {
            $row++;
            continue;
        }
        $row++;

        foreach (['table1', 'table2', 'table3', 'table4', 'table5'] as $table) {
            $stmt = $pdo->prepare("INSERT INTO $table (name, title) VALUES (?,?)");
            $stmt->execute([$data[0], $data[1]]);
        }
    }
    fclose($handle);
}

Или за UPDATE с uid заменете forech:

foreach (['table1', 'table2', 'table3', 'table4', 'table5'] as $table) {
    $stmt = $pdo->prepare("UPDATE $table SET name=?, title=? WHERE uid=?");
    $stmt->execute([$data[0], $data[1], $uid]);
}

Или още по-добре с INSERT или UPDATE, имайте предвид, че в този случай използваме именувани параметри.

foreach (['table1', 'table2', 'table3', 'table4', 'table5'] as $table) {
    $stmt = $pdo->prepare("INSERT INTO $table (uid, name, title) 
        VALUES (:uid, :name, :title) 
        ON DUPLICATE KEY UPDATE name=:name, title=:title");
    $stmt->bindValue('uid', $uid);
    $stmt->bindValue('name', $data[0]);
    $stmt->bindValue('title', $data[1]);
    $stmt->execute();
}

SQL за table1 .. table5

CREATE TABLE table1 (
 uid int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
 name varchar(255) NOT NULL,
 title varchar(255) NOT NULL,
 PRIMARY KEY (uid)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=8 DEFAULT CHARSET=utf8

Забележка: Когато опишете по-добре как искате да запазите уникалността, вероятно ще добавя някои други решения. В момента кодът не знае дали Джеймс, шеф от CSV, е същият Джеймс, шеф в DB.