Имах подобен проблем, когато започнах да използвам mysqli. Ако трябва да включите порта, той има свое собствено място в mysqli_connect .
$link = mysqli_connect("127.0.0.1", "username", "password", "dbname", 3306);
трябва да работи по-добре за вас. Но аз вярвам, че 3306 е портът по подразбиране, така че може да успеете просто да го оставите изключен.
