Използвайте:
SELECT i.uid
FROM ITEMS i
JOIN ITEM_TAGS it ON it.uid_local = i.uid
AND it.uid_foreign IN (1, 2)
GROUP BY i.uid
HAVING COUNT(DISTINCT it.uid_foreign) = 2
Трябва да имате дефинирани клауза GROUP BY и HAVING, а броят на отделните идентификатори на маркери трябва да е равен на броя на маркерите, които сте посочили в клаузата IN.