Външна стойност на колона за избор в обединена подзаявка?

Вашата вътрешна заявка е корелирана подзаявка, но изобщо не може да види table1. Това е ограничение за MySQL - вижте Ръководство за MySQL - D. 3. Ограничения за подзаявки . На около половината път надолу пише:

Въпреки че подзаявката е част от израза LEFT JOIN, това е част от клаузата FROM.

Тази преформулация може да ви свърши работа:

SELECT table1.id, 
       (SELECT COUNT(*)
        FROM table2
        WHERE table2.lt > table1.lt
        AND table2.rt < table1.rt) AS cnt
FROM table1;