Имах същия проблем след надстройка до osx Mojave и на python 3.7.2. Ето какво ми свърши работа:
# Required for mysqlclient, see brew info openssl
echo 'export PATH="/usr/local/opt/openssl/bin:$PATH"' >> ~/.bash_profile
export LDFLAGS="-L/usr/local/opt/openssl/lib"
export CPPFLAGS="-I/usr/local/opt/openssl/include"
pip3 install mysqlclient
Дано помогне. За повече вижте тук .