Датите/часовете се съхраняват в mysql по същия начин, независимо от това как са форматирани.
Вярвам, че това, което искате да направите, е да извлечете датата в определен формат.
DATE_FORMAT() ще направи това вместо вас.
http://dev .mysql.com/doc/refman/5.1/en/date-and-time-functions.html#function_date-format
%r и %T са съответно 12-часов и 24-часов формат.