Успях да разреша това, като направих следното:
- сравнението на db трябва да бъде
utf8_general_ci
- колекцията на таблицата с иврит трябва да бъде
utf8_general_ci
- във вашия скрипт за php връзка поставете
header('Content-Type: text/html; charset=utf-8');
- в xhtml маркер head поставете
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
- след като изберете db в скрипта за свързване, поставете
mysql_query("SET NAMES 'utf8'");