колона за актуализиране на mysql със стойност от друга таблица

В допълнение към този отговор, ако трябва динамично да промените tableB.value според tableA.value, можете да направите например:

UPDATE tableB
INNER JOIN tableA ON tableB.name = tableA.name
SET tableB.value = IF(tableA.value > 0, tableA.value, tableB.value)
WHERE tableA.name = 'Joe'