Можете просто да добавите WHERE
клауза за UPDATE
. Повече за това в документите на oracle.
Във вашия случай трябва да изглежда така:
...
WHEN MATCHED
THEN
UPDATE
SET tgt.column3= src.column3,
tgt.column4 = src.coulmn4
WHERE tgt.column3 IN (val1, val2)
WHEN NOT MATCHED
...