Проверете метода dbWriteTable
на пакета RJDBC
Ето един пример
dbWriteTable(jdbcConnection,"TABLE_NAME",data.frame.name., rownames=FALSE, overwrite = TRUE, append = FALSE)
Коригирайте опциите според нуждите. За презаписване на TRUE се създава нова таблица в схемата на вашия потребител за връзка.