Опитвате ли се да прехвърлите ftp файлове от кутия на Linux към Windows? Текстовите файлове имат ли съдържание на английски? Изглежда, че има несъответствие в набора от символи.
Старата версия на ftp сървъри/клиенти поддържаше само ASCII режим и по-късно бяха актуализирани, за да работят с UTF-8. Така че, моля, опитайте да актуализирате версията на ftp клиента.