Flask-Migrate не чете в базата данни, за да види зависимостите между обектите. Можете да постигнете успешна миграция, като пренаредите drop_table във вашия файл за миграция.
Това, което можете да направите, е да промените файла за мигриране по следния начин:
op.drop_table("parameter_subtype")
op.drop_table("parameter")
След това изпълнете командата за надграждане. Обикновено поръчването на изхвърлянето в този ред трябва да реши проблема.
