Използването на драйвера срещу .NET Core 2.0 определено е възможно. Просто трябва да се уверите, че препращате към сборката .NET Standard 1.5, която идва като част от следния пакет NuGet:
https://www.nuget.org/packages/MongoDB.Driver
Освен това новата версия 2.5 току-що беше пусната преди няколко дни, която вероятно работи най-добре срещу MongoDB 3.6.
Може да искате да прочетете и този урок:http:// www.qappdesign.com/using-mongodb-with-net-core-webapi/