Сортиране на записи по начин, така че само записите, които съответстват на идентификатор, да са първи?

Не мисля, че има пряк начин да направите това, ако наистина искате, опитайте $cond оператор за проверка на условието на конкретно поле,

• добавете ново поле matchResult в $project той ще провери createdBy съответства на върнато 1, в противен случай 0,
• $sort от matchResult в низходящ ред

const [messages, messageCount] = await Promise.all([
    MessageModel.aggregate([
        { $match: params },
        {
            $project: {
                ...filterObject,
                matchResult: {
                    $cond: [
                      { $eq: ["$createdBy", ObjectId("abcff9ef71fa048cea3c8a97")] },
                      1,
                      0
                    ]
                }
            }
        },
        { $sort: { matchResult: -1 } },
        { $skip: ctx.paginate.skip },
        { $limit: ctx.query.limit }
    ]),
    MessageModel.countDocuments(params),
]);

Playground

Втората опция е $regexMatch оператор за агрегиране, започвайки от MongoDB v4.2,

Playground