Passport.js и Mongoose.js попълват потребител при влизане - губи попълненото поле на req.user

Проблемът беше, че не попълвах полето във функцията passport.deserializeUser, ето актуализираната функция:

//deserialize
passport.deserializeUser(function(id, done) {
    User.findById(id)
    .populate('companyRoles._company', ['name', '_id'])
    .run(function (err, user) {
        done(err, user);
     });
});