Как да добавите стойности към bson.D обект

Добавете DocElem (mgo) или E (go.mongodb.org) към частта в зависимост от клиента, който използвате.

var setElements bson.D
if len(pivot.Base) > 0 {
  setElements = append(setElements, bson.E{"base", pivot.Base})
}
if len(pivot.Email) > 0 {
    setElements = append(setElements, bson.E{"email", pivot.Email})
}

setMap := bson.D{
    {"$set", setElements},
}

Заменете bson.E с bson.DocElem за mgo.