Уебсайтът на mongodb има документация за това какво да направите (само при спешни случаи), когато трябва да преконфигуриране на набор реплики, когато членовете не работят . Това звучи като ситуацията, в която се намирате.
По принцип, ако сте на версия>=2.0 и е спешно, можете да добавите force: true към командата за конфигуриране на набор от реплики.
