Проверете дали вашето копие на mongodump и самата база данни са една и съща версия.
Имах абсолютно същия проблем (без терминален изход или регистрационни файлове), когато се опитах да направя дъмп на сървър mongo 3.2.4 с клиент mongodump 2.4.1. Премахването на по-стария клиент и инсталирането на по-новия го разреши незабавно.
