Nestjs:Правилна схема за масив от поддокументи в mongoose (без _id по подразбиране или предефиниране на ObjectId)

Вашите members prop не е прост масив. Това е колекция от поддокументи и трябва да се декларира като [SchemaTypes.ObjectId] който ще имплементира поддокументи с _id поле чрез mongo по подразбиране ObjectID стойност:

@Prop({ type: [SchemaTypes.ObjectId], ref: 'GuildMember'})
members: GuildMember[]