От Ember 1.0.0-rc 1 и Ember Data ревизия 11 това изглежда е най-добрият начин за разрешаване на проблема.
App.Adapter = DS.RESTAdapter.extend({
serializer: DS.RESTSerializer.extend({
primaryKey: function(type){
return '_id';
}
})
});
App.Store = DS.Store.extend({
revision: 11,
adapter: 'App.Adapter'
});