Mongodb винаги създава файла mongodb.lock, когато сървърът стартира и го пуска, преди mongodb да бъде спрян.
Премахването на mongodb.lock не засяга никакви данни, а просто означава, че mongodb не е спрян правилно. Така че, вие сте прави, че премахвате този файл и стартирането с опцията -repair трябва да коригира базата данни.