Вашата заявка в PHP кода няма да доведе до желания резултат, защото сте го настроили Position и Secondary на същата стойност. Въз основа на предоставените от вас примерни данни, които няма да върнат нищо.
Ако търсите заявка за избор на отговарящи на условията играчи за dropdwon, можете да промените заявката да изглежда така:
SELECT * FROM `allsquads`
WHERE `Team` = '$t1select'
AND (`Position` = '$position[$i]' OR `Secondary` = '$position[$i]')
