Можете също така обикновено да използвате mysql клиента на самия сървър. Обикновено ми е любимо за импортирани големи БД.
mysql -u user -p -h localhost dbname < import.sql
Или във вашия случай, за да стигнете до командния ред (същото като SQL прозореца в phpmyadmin:
mysql -u user -p -h localhost dbname
